Ergenekon davasında 47 yıl 3 ay hapis cezası alan Arif Doğan, Ergenekon soruşturması kapsamında 14 Temmuz 2008 tarihinde Ankara’da gözaltına alınmıştı. Operasyon kapsamında Doğan’ın depo olarak kullandığı İstanbul Beykoz’daki bir evde yapılan aramalarda ise çok sayıda gizli olduğu belirtilen belge, 2 Kalaşnikof marka tüfek, bin adet mermi ve bin boş kovan ile 280 adet el bombası bulunmuştu. 

47 yıl 3 ay hapis cezası verilen Doğan, sağlık durumu ve yaşı dikkate alınarak adli kontrol uygulanması şartları kapsamında tahliye edilmişti. Silivri’de görülen duruşmalara tekerlekli sandalye ve oksijen tüpü ile katılan Doğan, JİTEM’i kendisinin kurduğunu ifade etmişti.

Doğan'ın yarın Düzce'de toprağa verileceği belirtildi.